定期檢驗不須花任何費用，是屬於免費服務性質，但若經排氣定期檢驗發現排氣濃度超過法定標準而判定為不合格時，檢驗站會對車輛做適度的調修，以使該車輛排放廢氣可達排放標準，所需費用由車主負擔，惟車主亦可至一般機車行進行調修後，再至檢驗站實施排氣檢驗。